Křížový kodér je model, který dostane dotaz a kandidátní text společně a přímo vyhodnotí, jak spolu souvisejí. Na rozdíl od běžného vyhledávání, které nejprve převede dotaz a dokument odděleně na vektory, může posoudit i jemné vztahy mezi jejich slovy a významem. Proto se často používá ve druhém kroku RAG vyhledávání: rychlá metoda vybere širší množinu kandidátů a křížový kodér je přesněji seřadí. Je přesnější, ale výpočetně náročnější, takže se obvykle nasazuje jen na omezený počet výsledků.